DNAKit

DNAKit: A Comprehensive Toolkit for Efficient DNA Research

DNAKit 是面向 DNA/基因方便操作的可复现分析工具包。它提供：

1. 数据准备： DNA 序列与注释文件读写、数据库下载与查询、合法性检查。
2. 数据处理： 序列标准化与编辑、转录与翻译、去重与聚类、数据集划分。
3. 数据分析： DNA 描述符、表征与指纹、序列与模式搜索、理化及热力学性质、深度学习性质预测。
4. 数据评价： 有效性、唯一性、多样性与新颖性评价，以及相似度、距离和序列比对。
5. 可视化： 序列文字图、位置高亮、线性与环状 DNA 图、序列比对图。
6. 大语言模型工具： 提供 Python API、MCP 接入、Skills 工作流与内置 Agent，支持通用大模型调用与自然语言任务执行。

支持与社区

Github仓库：github.com/mapengsen/DNAKit

微信社区：

引用 DNAKit

DNAKit 尚未发布论文或 DOI；当前版本的中文引用信息保存在仓库 README_CN.md 中，可引用为：

DNAKit contributors. DNAKit 0.1.5, 2026.

引用 DNAKit 不能替代对实际算法、参数集、后端和参考数据库的引用。项目使用的方法、论文、数据库和网站统一列在致谢与主要来源中；结果中的 Provenance、BackendInfo、ReferenceLibrary 和 RunManifest 用于保留这些信息。