通用搜索:参数与补充说明¶
用法和示例见功能教程。
各功能按作用、API、输入、输出、示例代码和结果说明介绍。运行前按说明准备凭据、本地文件与可选依赖;远程结果随数据库版本与查询时间变化。
使用远程 BLAST 检索相似蛋白质序列¶
dnakit.databases.blast_protein_search(*, sequence, database=None, expect=None, hitlist_size=None, verbose=True)
| 参数 | 类型 | 必填 / 默认值 | 说明与约束 |
|---|---|---|---|
sequence |
string | 必填 | Protein sequence to search (minimum 10 amino acids) |
database |
string | None | Database to search. Options: 'nr' (comprehensive but slow), 'swissprot' (curated, faster), 'pdb' (protein structures only) |
expect |
number | None | E-value threshold for reporting hits |
hitlist_size |
integer | None | Maximum number of hits to return |
verbose |
bool | True | 运行提示开关。 |