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通用搜索:参数与补充说明

用法和示例见功能教程。

各功能按作用、API、输入、输出、示例代码和结果说明介绍。运行前按说明准备凭据、本地文件与可选依赖;远程结果随数据库版本与查询时间变化。

使用远程 BLAST 检索相似蛋白质序列

dnakit.databases.blast_protein_search(*, sequence, database=None, expect=None, hitlist_size=None, verbose=True)

参数 类型 必填 / 默认值 说明与约束
sequence string 必填 Protein sequence to search (minimum 10 amino acids)
database string None Database to search. Options: 'nr' (comprehensive but slow), 'swissprot' (curated, faster), 'pdb' (protein structures only)
expect number None E-value threshold for reporting hits
hitlist_size integer None Maximum number of hits to return
verbose bool True 运行提示开关。